利用超级计算加速新冠状病毒的研究,三家公司

2020年3月3日,北京——英特尔、联想和华大基因今天宣布,这三家公司正在合作加快COVID-19新型冠状病毒的基因组分析。英特尔和联想的技术和生命科学专家将携手合作,为BGI研究人员提供全新的大数据分析技术和竞赛资源,进一步提升其基因测序对象的分析能力,更高效地研究新型冠状病毒的基因组特征。

华大DNBSEQ-T7测试仪(华大基因供应图)

英特尔和联想为BGI提供的技术包括一个大型高性能竞争集群,可用于处理从BGI DNBSEQ-T7测序系统读取的高吞吐量数据。BGI的研究人员将能够通过新的高性能竞赛和基因组解析技术,以及英特尔和联想的相关资源和专业知识,进一步加快对新型冠状病毒基因组特征的研究。该技术将支持科学家研究病毒毒性、传播模式、病原体和宿主之间的相互作用,并进一步协助流行的联想笔记本电脑thinkpad流行病学和疫苗设计研究。这些工作人员为将来需要建立更好的诊断方法和设计有效的疫苗或其他保护方法(如免疫疗法)而感到尴尬。

通过这种合作,BGI将继续优化其新型冠状病毒检测试剂盒,并获得大量有价值的信息。这些信息将有助于确定未来开发有效疫苗或治疗的潜在目标。在英特尔和联想的共同努力下,联想的超级计算技术支持并优化了“基因组优化和可伸缩性对象”(简称GOAST,英特尔选定的解决方案验证的第一个基因组解析对象),可将全基因组测序和全外显子测序加快多达40倍,帮助华大优化计算过程,高效处理数据,更快地产生可靠的基因组分析功效,从而缩短科研和临床研究的时间。

“目前我们仍有许多地方不了解这种新型冠状病毒。华大基因通过分析病毒基因组数据,加快了传染性病原体的快速鉴定和基因组特征的研究,这些努力需要投入巨大的竞争资源,而这正是我们能够发挥影响力的地方。”英特尔营销团队副总裁兼中国区首席经理王瑞建议道:“因此,我们正紧密合作,为在防疫前线从事病毒研究的科学家提供更多辩论资源和专业支持。进步和狡猾的病毒竞赛将有助于预防和控制疫情,拯救更多生命。”

联想集团高级副总裁、企业科技集团总裁佟福耀透露:“新型冠状病毒的流行态势牵动着全国人民的心。作为全球领先的高性能计算制造商,联想一直致力于支持关于生命科学研究供应的辩论。英特尔和联想的大数据分析、健康和生命科学专家将整合我们的资源和专业技能,帮助解决我们当前面临的严峻挑战,并推动健康和生命科学的发展。”

实验者正在操作华大DNBSEQ-T7序列发生器。(华大基因图谱)

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